Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSA0

Vmn1r223, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r223Q5SSA0 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vmn1r223Q5SSA0 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms