Protein–RNA interactions for Protein: Q5SPW0

Vps54, Vacuolar protein sorting-associated protein 54, mousemouse

Predictions only

Length 977 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps54Q5SPW0 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Vps54Q5SPW0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vps54Q5SPW0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms