Protein–RNA interactions for Protein: Q5QGU6

Rtp3, Receptor-transporting protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtp3Q5QGU6 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Rtp3Q5QGU6 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Rtp3Q5QGU6 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms