Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6bQ5NCY0 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6bQ5NCY0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6bQ5NCY0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Kdm6bQ5NCY0 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6bQ5NCY0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Kdm6bQ5NCY0 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Kdm6bQ5NCY0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Kdm6bQ5NCY0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms