Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ttf2Q5NC05 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ttf2Q5NC05 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms