Protein–RNA interactions for Protein: Q5F4S9

Trpm3, Transient receptor potential cation channel, subfamily M, member 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm3Q5F4S9 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Trpm3Q5F4S9 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.47
Trpm3Q5F4S9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Trpm3Q5F4S9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms