Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU56

Nlrc3, Protein NLRC3, mousemouse

Predictions only

Length 1,064 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc3Q5DU56 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Nlrc3Q5DU56 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Nlrc3Q5DU56 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.8 ms