Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU02

Usp22, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 22, mousemouse

Predictions only

Length 525 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp22Q5DU02 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Usp22Q5DU02 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Usp22Q5DU02 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms