Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Usp13Q5BKP2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Usp13Q5BKP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp13Q5BKP2 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms