Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Lrig2Q52KR2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Lrig2Q52KR2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Lrig2Q52KR2 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms