Protein–RNA interactions for Protein: Q4KL14

Trappc3l, Trafficking protein particle complex subunit 3-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc3lQ4KL14 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Trappc3lQ4KL14 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Trappc3lQ4KL14 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms