Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZF3

Ddx49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 480 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx49Q4FZF3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Ddx49Q4FZF3 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ddx49Q4FZF3 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
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Ddx49Q4FZF3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ddx49Q4FZF3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ddx49Q4FZF3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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