Protein–RNA interactions for Protein: Q4FK66

Prpf38a, Pre-mRNA-splicing factor 38A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf38aQ4FK66 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Prpf38aQ4FK66 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Prpf38aQ4FK66 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms