Protein–RNA interactions for Protein: Q497S0

Gm5935, EG546282 protein, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5935Q497S0 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Gm5935Q497S0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Gm5935Q497S0 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms