Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Fam220aQ3ZN08 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Fam220aQ3ZN08 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Fam220aQ3ZN08 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Fam220aQ3ZN08 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.8 ms