Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0V0

Ldlrad2, Low density lipoprotein receptor A domain-containing 2, mousemouse

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ldlrad2Q3V0V0 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ldlrad2Q3V0V0 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ldlrad2Q3V0V0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms