Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0G7

Garnl3, GTPase-activating Rap/Ran-GAP domain-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garnl3Q3V0G7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Garnl3Q3V0G7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Garnl3Q3V0G7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.6 ms