Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZ01

Rnpc3, RNA-binding protein 40, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 514 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnpc3Q3UZ01 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rnpc3Q3UZ01 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rnpc3Q3UZ01 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rnpc3Q3UZ01 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms