Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWZ0

Trim75, Tripartite motif-containing protein 75, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim75Q3UWZ0 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Trim75Q3UWZ0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Trim75Q3UWZ0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms