Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW98

Clca4b, Chloride channel accessory 4B, mousemouse

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca4bQ3UW98 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Clca4bQ3UW98 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Clca4bQ3UW98 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms