Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUY6

Prom2, Prominin-2, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prom2Q3UUY6 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prom2Q3UUY6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prom2Q3UUY6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms