Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
H2-Eb2Q3UUV9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms