Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU67

Trat1, T-cell receptor-associated transmembrane adapter 1, mousemouse

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trat1Q3UU67 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trat1Q3UU67 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26 ms