Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU43

Chpf2, Hexosyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 768 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chpf2Q3UU43 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Chpf2Q3UU43 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Chpf2Q3UU43 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Chpf2Q3UU43 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms