Protein–RNA interactions for Protein: Q3USS0

Gm6899, Predicted gene 6899, mousemouse

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6899Q3USS0 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Gm6899Q3USS0 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Gm6899Q3USS0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
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