Protein–RNA interactions for Protein: Q3USL1

Klhdc9, Kelch domain-containing protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhdc9Q3USL1 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Klhdc9Q3USL1 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Klhdc9Q3USL1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Klhdc9Q3USL1 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms