Protein–RNA interactions for Protein: Q3US59

Gm28047, Predicted gene, 28047, mousemouse

Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm28047Q3US59 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Gm28047Q3US59 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Gm28047Q3US59 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms