Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ccdc190Q3URK1 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc190Q3URK1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms