Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.35
E130208F15RikQ3UPV3 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.83□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms