Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Skap2Q3UND0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Skap2Q3UND0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms