Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJF0

Gpr55, G-protein coupled receptor 55, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpr55Q3UJF0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Gpr55Q3UJF0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gpr55Q3UJF0 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.3 ms