Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJD6

Usp19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, mousemouse

Predictions only

Length 1,360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp19Q3UJD6 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp19Q3UJD6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp19Q3UJD6 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms