Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Edc4Q3UJB9 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Edc4Q3UJB9 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Edc4Q3UJB9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms