Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Sf3b2Q3UJB0 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Sf3b2Q3UJB0 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Sf3b2Q3UJB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms