Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ccdc34Q3UI66 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ccdc34Q3UI66 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ccdc34Q3UI66 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms