Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI43

Babam1, BRISC and BRCA1-A complex member 1, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Babam1Q3UI43 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Babam1Q3UI43 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Babam1Q3UI43 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms