Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFT3

Garem1, GRB2-associated and regulator of MAPK protein, mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Garem1Q3UFT3 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Garem1Q3UFT3 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Garem1Q3UFT3 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms