Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFS0

Zyg11b, Protein zyg-11 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 744 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zyg11bQ3UFS0 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Zyg11bQ3UFS0 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zyg11bQ3UFS0 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zyg11bQ3UFS0 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Zyg11bQ3UFS0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Zyg11bQ3UFS0 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Zyg11bQ3UFS0 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Zyg11bQ3UFS0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms