Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ttll12Q3UDE2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ttll12Q3UDE2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms