Protein–RNA interactions for Protein: Q3U9G9

Lbr, Lamin-B receptor, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LbrQ3U9G9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
LbrQ3U9G9 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
LbrQ3U9G9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
LbrQ3U9G9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms