Protein–RNA interactions for Protein: Q3U6N9

UPF0488 protein C8orf33 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U6N9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q3U6N9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q3U6N9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q3U6N9 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms