Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Lmf1Q3U3R4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Lmf1Q3U3R4 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms