Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2K0

Fam193b, Protein FAM193B, mousemouse

Predictions only

Length 892 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam193bQ3U2K0 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam193bQ3U2K0 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Fam193bQ3U2K0 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.9 ms