Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
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Rnf149Q3U2C5 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf149Q3U2C5 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Rnf149Q3U2C5 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
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Rnf149Q3U2C5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Rnf149Q3U2C5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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Rnf149Q3U2C5 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf149Q3U2C5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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Rnf149Q3U2C5 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
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