Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0Y2

Tmem35b, Transmembrane protein 35B, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem35bQ3U0Y2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Tmem35bQ3U0Y2 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Tmem35bQ3U0Y2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms