Protein–RNA interactions for Protein: Q3U0S6

Rasip1, Ras-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 961 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasip1Q3U0S6 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Rasip1Q3U0S6 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasip1Q3U0S6 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms