Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWN3

Cnnm2, Metal transporter CNNM2, mousemouse

Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnnm2Q3TWN3 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cnnm2Q3TWN3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Ypel3-201ENSMUST00000038614 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cnnm2Q3TWN3 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cnnm2Q3TWN3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.5 ms