Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWL2

Pip4p1, Type 1 phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 4-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 284 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pip4p1Q3TWL2 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Pip4p1Q3TWL2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Pip4p1Q3TWL2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Pip4p1Q3TWL2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 94.6 ms