Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVC7

Ccndbp1, Cyclin-D1-binding protein 1, mousemouse

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccndbp1Q3TVC7 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Ccndbp1Q3TVC7 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Ccndbp1Q3TVC7 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
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