Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.1■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC33.08■■■□□ 2.89
Ccdc136Q3TVA9 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.07■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC33.03■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.02■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
Ccdc136Q3TVA9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.97■■■□□ 2.87
Ccdc136Q3TVA9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC32.97■■■□□ 2.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms